Một bức thư đe dọa đã gửi tới ngài Asakura - thị trưởng thành phố Tokyo. Ngày hôm sau, đoạn hầm chui đã bị nổ tung khi chuyến tàu khai trương chờ ngài thị trưởng chạy tới.
Biết được thông tin về lá thư khủng bố, Conan đã làm hết sức mình để ngăn chặn thảm họa xảy ra ngay trước mắt.
Vụ việc này dường như có quan hệ với một vụ tai nạn giao thông xảy ra tại khu làng tái định cư công trình đập thủy điện 8 năm về trước.
Cậu thiếu niên bị mất trí nhớ tên Tachihara Touma dường như là mắt xích quan trọng trong vụ án lần này...
